绝大多数的肝内钙化灶并不严重，是一种较为常见的疾病，由钙盐异常沉积在肝组织内所致，患者无明显的症状，常在体检或因其它疾病进行检查时被发现。绝大多数的肝内钙化灶患者不需要治疗，定期观察随访即可。若钙化灶出现在肝炎、肝结核、肝包虫病、肝脓肿、肝癌等疾病所导致的肝病变组织中或合并上述疾病，则需要根据原有的基础疾病类型、严重程度，选择恰当的方法进行治疗。治疗肝内钙化灶的前提是明确有无基础性的肝脏疾病，大多数患者可定期观察随访，对于有明确肝脏疾病的患者应该给予对因治疗，必要时辅以对症治疗。

根据疾病的类型选择恰当的治疗方法，改善患者症状，比如对于各类肝炎引起的钙化灶，应该以药物治疗为基础，如病毒性肝炎患者有指征时，需要接受抗病毒药物治疗。自身免疫性肝炎患者则需要接受免疫抑制剂的治疗，服用保肝药物及抗纤维化药物，以控制炎症和纤维化的发展。如果是肝包虫病，首选的治疗方法是手术完整切除病灶，病情较重者可以选择姑息性切除，部分条件允许者可选择肝移植，药物治疗是手术治疗的重要辅助手段，首选的药物是阿苯达唑。