目前数据显示，二代试管婴儿畸形率与一代试管婴儿、自然怀孕女性，发生不良事件几率基本一致，患者无需过度担心。二代试管主要针对精卵结合障碍的一系列不孕症男性或者女性采用的妊娠方式，主要多见于重度少弱畸形精子症，或梗阻性无精子症患者，只能从睾丸或附睾中取到精子，无法完成自然受精过程。如果患者进行二代试管婴儿胚胎植入前，进行筛查或诊断，则此时相对胚胎出现问题的概率比自然怀孕几率低。
如果备孕者没有上述问题，建议让精子经过自然优胜劣汰与卵子结合，如果在精和卵结合过程中，精子能够进入到卵细胞中，则成功受精的精子能力较强。因此，建议备孕者如果可进行一代试管婴儿，尽量避免选择进行二代试管婴儿。
