如果病情允许，微创手术具有创伤小、恢复快的优点，则首选微创外科手术。对于胆结石，包括胆囊结石、肝内和肝外胆管结石，目前腹腔镜胆囊切除是胆囊疾病的首选手术方式，绝大多数的胆囊切除都可以通过微创腹腔镜下来完成，手术后患者第二天就可以出院。
而肝内和肝外胆管结石也要根据结石的具体部位、患者的身体状况以及当地的医疗条件，采取开腹或微创手术治疗。肝内胆管结石可以通过胆管切开取石或肝部分切除来完成，而肝外胆管结石也可以进行微创的胆管切开取石、Ⅰ期缝合胆管。
无论是哪种手术方式，只要是微创手术条件允许，都应该尽量首选微创手术治疗，对于手术比较复杂、难度较大或者是结石难以取出，或者是多次手术的患者，开腹手术对于患者而言有时也要必须进行。
