小儿咽峡炎是急性上呼吸道感染的其中一部分，大部分咽峡炎是病毒感染，尤其是A组柯萨奇病毒感染所引起的疱疹性咽峡炎。小儿咽峡炎的治疗主要包括以下两部分：

1、对因治疗：对因治疗就是针对咽峡炎的病因或病原进行治疗，大部分小儿咽峡炎是由病毒感染所引起，所以不需要特殊的抗病毒治疗，只需要等待自然病程即可。部分小儿可能因为细菌、支原体、衣原体等感染所引起，部分小儿在咽峡炎的中后期可能会继发细菌感染。这时候如果有证据证明小儿有细菌感染，或支原体、衣原体等特殊病原感染，可以使用抗生素或抗支原体的药物，有助于缩短病程以及症状好转；

2、对症治疗：小儿咽峡炎通常会有发热，所以在小儿体温比较高、比较不舒服的情况下，给小儿使用退热药，比如对乙酰氨基酚、布洛芬等。如果小儿有比较明显的咽痛表现，年龄偏大的小儿可以使用口喷剂或含片，帮助小儿缓解咽痛症状。

总体而言，需要等1-2周的病程，小儿咽峡炎会逐渐好转。