睾丸是精子合成、分泌的器官，内部实际上是由曲细精管、生精小管等管道系统组成的器官，在显微镜下可以看见睾丸内部富含这种管道系统。如果局部发生感染性病变，很容易导致管道出现感染性狭窄、梗阻，局部精子和精液潴留、排泌困难。潴留的精液随着时间推移会逐渐固化，甚至可能会出现局部钙化，在影像学上很容易就表现为结石或者微石症。
所以睾丸微石症仅反应睾丸排泌管道出现微小局部病变，产生局部精液潴留、固化和钙化、结石化等情况。睾丸微石症在临床上基本不用进行特殊治疗，其反映的是既往的局部感染性病变，而且已经临床治愈的状态。
