通常不推荐女性在月经期间进行阴超。经期宫颈管和子宫处于开放松弛状态，此时女性抵抗力较差，经阴道检查会加重上行感染的可能性，且在月经期间子宫内膜出现中心剥脱，此时无法测量子宫内膜厚度。
部分女性由于种种原因，可能需要在月经期间或阴道出血期间进行B超检测，此时建议患者找正规医院以及医生采用严格无菌措施，如用一次性避孕套套在阴道探头上进行相对应操作。除对子宫内膜判断有些许误差外，此时子宫体、宫颈及卵巢大部分检查结果有一定可信度。
卵巢囊肿问题也需辨证判断，如果在月经期发现卵巢囊肿，多采用观察处理，因为生理性卵巢囊肿在月经结束后会消失。因此在月经期间进行B超，除子宫内膜和卵巢囊肿需特别对待以外，大部分检查结果有一定可信度。
