一般做肠镜检查主要是做结肠镜检查，不需要住院，大部分医院都是在门诊进行结肠镜检查。但是要注意，如果患者之前做结肠镜检查已经明确具体病变，如有较大息肉或肿物，需要在肠镜下进行治疗，要听医生意见，决定是否需要住院治疗，部分医院要求住院接受治疗，但有的三甲医院床位较为紧张，可能不住院治疗或通过密切观察，判断是否住院治疗。如果是年老体弱的人，在家中喝泻药导致危险情况者，可能医生会酌情建议住院进行肠镜检查。
一般进行普通结肠镜筛查时不需要住院，无论是清醒状态下进行结肠镜检查，还是无痛麻醉状态下进行结肠镜检查，都不需要住院。结肠镜检查是对肠道病变较为直观的了解方式，在结肠镜下可以直观看到病变，也可以进行病理组织检查。
