严重的胆汁反流性胃炎，在治疗上要针对胆汁反流进行处理。针对胆汁反流，需要用到的药物，包括铝碳酸镁，具有比较好的中和胆汁酸作用，能够起到比较好的、比较理想的治疗作用。
胆汁反流也可以用熊去氧胆酸药物，适当改变胆汁酸成分，抑制疏水性胆汁酸，对胆汁反流有一定作用。对于胆汁反流，可以适当用促动力药物，比如吗丁啉(多潘立酮片)、莫沙必利、伊托必利等，能够起到一定的减轻胆汁反流作用，会对胆汁反流性胃炎起到一定治疗作用，此为可以尝试的办法。
对胆汁反流性胃炎的治疗，上述药物是基础用药，还要结合相应症状进行治疗。如果症状比较重、比较明显，有肌肉痛症状，则需要用抑酸药物。如果有消化不良症状，比如胃胀、嗳气症状，可以用促消化的消化酶进行治疗。
总而言之，要针对患者相关的症状和病因，进行对应处理。
