血清高密度脂蛋白胆固醇偏低，因肝脏肝细胞合成的载脂蛋白A1和低密度脂蛋白偏低引起，因为血清的高密度脂蛋白，主要是肝脏合成的载脂蛋白A1，其与一些血脂成分结合从而形成了高密度脂蛋白。

因为载脂蛋白A1是高密度脂蛋白里面最重要的成分，此种成分在肝脏合成，随着年龄的增加，高密度脂蛋白的合成会下降，因此高密度脂蛋白偏低或者高密度脂蛋白胆固醇偏低，在临床上很常见，特别是在老年人群中。

高密度脂蛋白胆固醇是对人体有利的胆固醇，因为高密度脂蛋白可以到外周组织，把外周组织的胆固醇运回到肝脏代谢，所以认为高密度脂蛋白是一个抗动脉粥样硬化的脂蛋白，可以使动脉血管发生动脉粥样硬化的概率下降。

但在临床上，高密度脂蛋白偏低很常见，高密度脂蛋白偏低时，需要给予药物治疗。目前治疗高密度脂蛋白偏低的药物主要是他汀类药物、贝特类药物、烟酸类药物，上述药物都具有升高高密度脂蛋白胆固醇的效果，大概升高10%。