微浸润癌和原位癌的主要区别是浸润深度的区别。如果浸润超过基底膜，但在微浸润癌的浸润深度范围内，就属于微浸润癌。微浸润癌是原位癌的继续发展，原位癌指的是癌细胞局限在上皮层内，没有穿透基底膜向深层发生浸润。

原位癌属于癌的最早期阶段，如果能够在原位癌阶段发现癌的存在，通常可以通过根治性手术切除治疗，使原位癌获得治愈，一般不会出现复发和转移的情况，绝大多数预后比较好。

如果在原位癌阶段没有发现或者积极治疗，癌细胞就可以继续向深层发生浸润，可以穿透基底膜侵入基底膜深层的间质当中，这个时候就称为微浸润癌。微浸润癌的浸润深度通常不超过基底膜下的5mm，如果超过5mm，就不是微浸润癌，而称为浸润性癌。

微浸润癌虽然大多数，也属于早期，一般不发生复发和转移，但癌细胞一旦穿透基底膜，还是有机会侵入到淋巴管或者血管当中，从而发生转移的情况。所以对于微浸润癌要更加积极的治疗。