如果单纯胃蛋白酶原Ⅱ偏高，不代表胃癌。胃功能检测包括胃蛋白酶原Ⅰ、胃蛋白酶原Ⅱ和胃泌素，三项指标主要反应胃黏膜状态和功能，可以进行胃功能的动态监测，监测是否是胃癌。
这三项指标如果同时明显增高，高度提示可能出现胃癌。如果胃蛋白酶原Ⅰ、胃蛋白酶原Ⅱ轻度升高，提示胃黏膜炎症改变。如果检测指标偏低，提示胃黏膜萎缩。
胃蛋白酶原Ⅱ如果偏高，考虑可能是慢性胃炎，需要进一步胃镜检查。胃镜检查可以在内镜下进行观察，如果是萎缩性胃炎，胃窦黏膜会变薄，血管显露，甚至黏膜粗糙，病理取材可以看到胃腺体萎缩，可以确诊萎缩性胃炎。
如果看到胃黏膜出现溃疡或隆起病变，形态不规则，同时病理取材提示肿瘤发生，可以确诊胃癌。如果仅出现胃黏膜充血、水肿、糜烂表现，取材只是黏膜炎症明显或有炎性细胞浸润，则为慢性浅表性胃炎。
