肺部肉芽肿的治疗，通常要依据肺部肉芽肿的病因，采取相应的药物治疗和手术治疗，常见治疗方式如下：

1、切除异物：通常中心是异物，周围有淋巴细胞、巨噬细胞、上皮样细胞、成纤维细胞包裹，主要通过手术切除，切除后通常可以缓解；

2、控制炎症：常见结核菌感染导致的结核性肉芽肿，通常进行全身抗结核治疗，较大的结核性肉芽肿，要通过手术切除，尤其是肺外肉芽肿，炎症内有寄生虫、真菌或者其他细菌感染，可使用头孢治疗、抗真菌治疗、抗寄生虫治疗。如果不能缓解，则需要进行手术切除；

3、免疫抑制治疗：自身免疫系统疾病，即肺结节病，形成非坏死性肉芽肿，主要进行免疫抑制治疗。