宝宝长鹅口疮的原因，通常是由于真菌感染导致，这种真菌称为白色念珠菌，是导致宝宝长鹅口疮的主要原因。
白色念珠菌感染到宝宝口腔最常见的原因是卫生习惯不好，宝宝黏膜局部的分泌性IgA含量比较低，容易受到感染，如果外界接触到白色念珠菌，通常比较容易在口腔内生长繁殖。口腔是一个温暖、湿润的环境，比较适合于真菌生长，因此宝宝容易长鹅口疮。
建议患者应注意卫生，如宝宝喝奶的奶嘴、奶瓶，甚至母亲乳房的卫生清洁都非常重要，可有效防止宝宝出现鹅口疮。
当宝宝机体抵抗力比较弱，局部分泌性的IgA比较低时，就容易长鹅口疮，鹅口疮严重时可以导致全身真菌感染，而较轻的局部感染，通常会影响宝宝的吃奶。因此宝宝长鹅口疮后，应及时进行处理和治疗，以免病情加重，影响宝宝身体健康。
