自身免疫性肝炎的发病机制是由于人体自身的免疫系统发生功能障碍、发生紊乱，产生针对自身的肝细胞的抗体损伤肝细胞，引起肝脏的炎症。通常很难治愈，但也有很多手段、药物能很好地控制自身免疫性肝炎的活动。
自身免疫性肝炎的活动如果控制得好，不会出现晚期的并发症。控制自身免疫性肝炎，首先要对自身免疫性肝炎进行具体的分型，要进行肝穿刺活检，做肝组织病理进行分型。有自身免疫性肝炎和原发性胆汁性肝硬化，针对不同的型别，其用药也不一样。
自身免性肝炎通过积极有效且准确的治疗以后，肝脏的炎症都可以逐渐平息，从而避免出现肝硬化以及远期的并发症。虽然自身免疫性肝炎不能治愈，但如果能控制得好，也可以达到治疗目标。
