患者选择抗生素方面，区分病原菌为革兰氏阴性菌或革兰氏阳性菌具有重要意义，常见的革兰氏阳性菌与革兰氏阴性菌如下：
1、革兰氏阳性菌：包括葡萄球菌、链球菌、肺炎双球菌等细菌，大多数革兰氏阳性菌对青霉素类抗生素敏感；
2、革兰氏阴性菌：包括痢疾杆菌、大肠杆菌、伤寒杆菌、变形杆菌，铜绿假单胞菌等细菌，革兰氏阴性菌通常对青霉素抗生素不敏感，对四环素类、碳青霉烯类抗生素比较敏感。
革兰氏阳性和革兰氏阴性菌，是根据革兰染色法对细菌进行的分类，即细菌先经碱性染料结晶染色，再经碘液媒染后使用酒精脱色，在一定条件下，部分细菌不脱色，部分细菌可以被脱去颜色，前者称革兰氏阳性菌，后者则称革兰氏阴性菌。为方便观察脱色后的细菌，同时会使用红色染料，如碱性番红等进行复染，此时革兰氏阳性菌仍带紫色，革兰氏阴性菌则会被染上红色。另外革兰氏阳性菌细胞壁肽聚糖较厚，有磷壁酸但无外膜，而革兰氏阴性菌的钛聚糖较薄，无磷壁酸但有外膜。
