对于尿道感染流脓的患者，至少需要1-2周的有效抗生素治疗才能够完全治愈。尿道感染流脓可能属于比较严重的尿路感染，如男性常见的淋病，可能会出现流脓的现象，此时可以通过尿常规脓液的涂片或者培养寻找致病菌。比如对于淋病而言，在通过脓液的涂片找到淋球菌后则可以诊断。
对于尿道流脓的感染，首选药物是通过静脉或者肌肉注射的抗生素，包括三代头孢，比如头孢曲松钠，可以有效地控制流脓的现象。治疗时一般需要输液2-3天，还需要继续口服抗生素1-2周。治疗后需要复查尿常规，只有当症状完全消失，尿常规检查白细胞完全转阴，才可认为是治愈。而在患者治愈后，也应注意预防复发，如多饮水、排尿、禁止饮酒、注意性生活的卫生。对于患者的性伴侣也需要进行治疗，从而尽可能地减少复发。
