盐酸小檗碱片主要是可以用于治疗胃肠道感染，此药一般没有明显的副作用，即使出现偶尔的副作用，症状通常也较轻，而且大多数是一过性，多数患者可以耐受。
部分患者可能会出现恶心、呕吐等相关症状，个别患者还有可能会出现皮疹等过敏情况，也有可能导致患者出现药物热。一般而言，盐酸小檗碱片的不良反应的发生率很低。
但是在使用时需要注意，如果患者有溶血性贫血，不建议使用此药。另外，对于妊娠期前3个月的孕妇，也不推荐使用此药。除此之外，盐酸小檗碱片可能和含有鞣质的中药发生药物相互作用，有可能会形成不溶性的沉淀，从而会影响药物治疗效果。
因此在使用盐酸小檗碱片时，应该特别注意，如果使用其他的中药一定要小心，最好能够咨询医生或者药师是否存在药物相互作用。
