头颅CT和头颅核磁共振从成像原理、显示的结构优势方面都不一样，具体如下：
1、头颅CT：需要结合X射线、电子计算机技术来进行成像，头颅CT的优势是对骨骼结构、颅内一些大的病变可以较好的显示，对于头外伤骨折成像是头颅CT的优势所在。头颅CT早期对出血比较敏感，出血在头颅CT上面可以表现为高密度影，因此头颅CT可以用于早期脑梗塞的筛查，可以表现为皮髓质界限的不清，或者是低密度的影，缺点在于需要射线；
2、头颅核磁共振：成像原理与头颅CT不同，主要是氢质子在磁场中的运动。头颅核磁共振无法显示骨骼这些结构，但优势在于对一些小的病灶比头颅CT显示得更加清楚，尤其是小脑、脑干这些后颅窝的病变，不容易受到尾影的影响，且核磁不需要使用射线。还有可能身上有金属物品的患者，不适合进行头颅核磁共振的检查。
至于每个患者需要进行何种检查，需要结合疾病特点，还有自身的一些情况来进行选择。
