肩胛骨疼痛的原因主要包括外伤骨折、局部肿瘤、颈椎病等疾病，具体情况如下：

1、外伤骨折：如果肩胛骨发生外伤骨折，会引起骨折端移位、出血，会有水肿，也会有肩胛骨的剧烈且持续的疼痛症状，并伴有局部畸形、肩关节活动受限，拍摄X光片或者三维CT能够进一步确诊；

2、骨肿瘤：原发性骨肿瘤，或者继发性骨肿瘤均可以发生在肩胛骨，引起骨质破坏、骨膜反应，导致肩胛骨疼痛，并伴有局部包块形成。通过CT扫描、病理组织学检查，能够进一步确诊；

3、颈椎病等疾病：如果患者有颈椎病等疾病，可以引起肩胛骨神经支配区域放射性疼痛，并伴有颈部疼痛、颈椎活动受限，通过颈椎核磁共振检查能够进一步确诊。而冠心病、肝胆疾病，也可以通过内脏神经、脊神经的联系引起肩胛骨区牵涉性疼痛。

综上所述，肩胛骨疼痛患者应该引起高度重视，尽快到医院专科门诊就诊，由专科医生为患者进行详细检查，尽快确定肩胛骨疼痛的具体病因。根据病因选择合适的治疗方法进行治疗，控制疼痛、恢复功能。