食管裂孔疝的手术是针对食管下段及胃底进行，手术的过程是对食管的下端以及胃底、贲门的位置，通过适当的游离，将其从胸腔重新拉入到腹腔，然后针对食管裂孔来做修复，对胃底做包埋，甚至针对食管下端做缝合固定来防止新的反流发生。

以上操作对于食管还有胃底的消化道功能而言，有一定影响，手术之后大部分病人需要1-2天的时间来进行消化道功能的重新恢复，之后消化道功能会恢复正常。