不建议圆锥角膜患者做近视眼手术，因为圆锥角膜是角膜病变，角膜中央区会隆起、变薄，会产生度数改变及不规则散光。
圆锥角膜患者的角膜可能会变得较薄，做近视眼手术，如角膜切削激光手术，有可能因对角膜进一步切削而使之更薄，会加重圆锥角膜引起的危害，甚至造成角膜穿孔，这种危害通常难以控制。
眼内晶体植入手术可能可以做，但由于圆锥角膜是进行性进展的疾病，装上晶体后，目前的不规则散光还是不能纠正，所以视功能难以得到有效纠正。随着疾病进展，甚至有可能需要做角膜移植手术。
这些情况都会对术后的视觉质量、视功能、度数产生一定影响，因此不建议圆锥角膜患者去进行角膜切削或眼内晶体植入手术。圆锥角膜患者可以在做角膜交联术的同时戴硬性角膜接触镜，来纠正不规则散光，并控制圆锥角膜进展。
