通常所说的骨质增生是由于关节磨损和退化导致，因为关节出现磨损和退化以后，关节的间隙就会变大，关节周围的韧带会出现一定程度的松弛。
这种情况下，人体为了获得关节的重新稳定，会在关节的边缘额外长出来一些骨头，把磨损的间隙给填充起来，把周围的韧带给支撑起来，这样来获得关节的稳定。
还有一些骨质增生发生在肌腱软组织里，本身不应该长骨头的地方长出来了骨头，如肩关节周围的钙化性肌腱炎，还有一些术后的病人，或者外伤的病人，在外伤的局部软组织里，也会长出来骨头，叫异位骨化，最常见的原因是外伤或者手术创伤所导致。
还有一部分的原因，如钙化性肌腱炎，可能是肌腱组织的慢性劳损炎症所形成的钙化。还有一类骨质增生通常发生在脚后跟，在其后方或者是下方长出增生的骨头、骨刺。其原因不是特别清楚，可能跟脚后跟局部的软组织长期劳损、发炎有关系。
