头神经痛多数是神经病变所引起，神经病变的因素常见以下情况：
1、神经可能会受到病毒感染，出现带状疱疹病毒时会表现为剧烈神经痛，是神经病变的常见原因；
2、部分神经会发生病变、变性，神经表面鞘膜如同电线、电缆表面的绝缘塑料，时间长后会破损，与外部短路会引起头部神经痛。常见的三叉神经因为在脑中与血管在一起，血管随着患者年龄增加会越来越硬，坚硬的血管会挤压神经，引起神经表面的鞘膜变性，引起三叉神经痛。枕大神经痛也有类似机制，枕大神经会和枕动脉相互打扰或者枕大神经往浅表移行时，肌肉肌腱磨损、压迫引起神经变性，进而引起相应的神经疼痛。
