卵巢巧克力囊肿可能会变小，比如在采取保守治疗，病人进入绝经期等情况下，具体如下：
1、采取保守治疗：比如服用唯散宁(地诺孕素片)进行治疗、肌肉注射醋酸曲普瑞林。上述药物可促进子宫内膜萎缩，此时子宫内膜不再出现周期性脱落、不再出血，巧克力囊肿局部也不会再次出血。因此，在药物的作用下，巧克力囊肿可能变小；
2、病人进入绝经期：若病人进入绝经期，此时卵巢不再周期性分泌雌激素和孕激素，子宫内膜不再发生周期性变化。此时巧克力囊肿也可能变小。
若是生育年龄的女性，在没有用药的情况下，巧克力囊肿通常不会变小，反而会继续增大。此外，在临床上若是直径＞4公分的巧克力囊肿，建议进行手术治疗。否则随着囊肿增大、内部压力增高可能会导致囊肿破裂。此时不仅会引起病人突然出现严重的下腹部疼痛，还可能导致更加严重的后果。
