婴儿耳朵流脓的原因，具体如下：

1、外耳道的耵聍：外耳道的耵聍即耳屎，此时婴儿耳朵流出来的可能不是脓而是耵聍，比如婴儿洗澡后、游泳后，耵聍融化之后可引起流水。此时让医生拿棉签给婴儿的耳朵擦一擦，擦掉后拿吸引器给吸出来即可，一般也不需要特别处理；

2、炎症：如外耳道或中耳的急、慢性炎症引起的流水。此时的治疗主要就是保持外耳道清洁，此时也可口服敏感的抗生素，比如阿莫西林克拉维酸钾、头孢类抗生素等。但需要注意，一般婴儿不能应用氧氟沙星滴耳液；

3、外耳道的湿疹：尤其有些婴儿对母乳过敏或是对鸡蛋过敏。此时尽量避开过敏原，也可以给婴儿喂抗过敏的药物，比如氯雷他定糖浆、盐酸西替利嗪糖浆等，上述药物可减少湿疹渗出，局部也可以涂抹湿疹膏；

4、外耳道的异物：因为婴儿可能对一些东西比较好奇，可能会把圆珠形的东西塞到耳朵里。若家长没有及时发现，异物在耳朵里面待的时间长以后会引起感染，进而引起流脓。此时家长一定要带婴儿到医院看一下，医生可用耳内镜直视婴儿的耳朵来查明原因。若是异物导致婴儿耳朵流脓就及时将异物取出，再将局部的外耳道进行清理，即可改善婴儿耳朵流脓的症状。