耐药菌感染可能可以治好，但也可能的确很难治，取决于耐药菌感染的耐药性、耐药菌感染所在的部位以及耐药菌感染部位对人体造成的影响。
如果耐药菌感染是包茎严重的情况，比如几乎对现有的抗生素全部耐药，手里没有武器将耐药菌杀灭，此时便比较难治好。耐药菌感染的部位对人体而言比较关键和重要，比如脑部感染这时要将其治好，难度也就大得多。
而如果耐药菌感染并不是对所有的药物都耐药，只是对一部分药物耐药，这时还是有机会选择适合的抗生素，这种情况下治疗的难度当然就会小得多。
此外，还有的时候耐药菌感染的部位在比较容易够得到的部位，比如皮肤或者软组织脓肿，便比较方便将脓肿引流出来或者将局部病灶清除掉，这时治疗难度也就相对会小。
