坐飞机耳膜穿孔最主要的原因是鼓膜内面和外面承受着不同的压力，有一侧压力非常大，另外一侧压力很弱，或者是原来两侧的压力基本相等，突然一侧压力加大后把鼓膜顶压破。当然有的鼓膜比较厚，不容易破，有的鼓膜很薄，如有的患者得过中耳炎，穿孔后会形成疤痕，鼓膜会特别薄，在极端的气压差情况下就会产生穿孔。
坐飞机气压会有变化，一般在高空时气压相对低，降落到地面的过程中气压逐步增大，容易产生鼓膜穿孔或者产生航空性中耳炎。鼻咽部的炎症、慢性鼻窦炎甚至鼻息肉，或者是急性上呼吸道感染，甚至于感冒都可能会造成咽鼓管堵塞。咽鼓管是中耳腔唯一跟外面相通的通道，堵塞以后中耳腔里面的空气慢慢被吸收掉，造成很明显的负压，鼓膜会内陷。里面的软组织成分会随着负压，渗透到鼓室腔，造成鼓室腔积液，所以感冒、上呼吸道感染或者鼻窦炎造成咽鼓管堵塞的情况下不要去坐飞机，这样会产生非常不好的后果。
