急性化脓性扁桃体炎主要是细菌感染所引起，这时需要正规给宝宝使用抗生素，比如可以使用青霉素或者头孢类抗生素。只要宝宝不过敏，就可以使用相应的抗生素。
有些宝宝出现过敏，也可以使用大环内酯类抗生素，比如阿奇霉素等。这些对于急性化脓性扁桃体炎的恢复、病程的缩短和症状的缓解都是有比较好的作用，也是从根本上去治疗急性化脓性扁桃体炎的方式。
特别注意抗生素的抗感染疗程要用够，不要用个2-3天药就不用了，以免导致宝宝局部抗感染不彻底，从而反复发病，继发肾小球肾炎等并发症。除此之外，针对宝宝急性化脓性扁桃体炎的症状做相应的处理和用药，比如宝宝会有比较明显的发热。
这时可以给宝宝吃退烧药，像对乙酰氨基酚或者布洛芬都是较安全的退烧药，可以正常使用。如果是大宝宝局部咽痛表现比较明显，可以给宝宝使用口喷剂或者使用含片帮助缓解局部咽痛的症状。总体来说只要积极抗感染和对症治疗，宝宝很快就会恢复。
