喝硫酸镁以后，大概半个小时开始起效，2-3小时能够排干净80%以上。但现在临床上喝硫酸镁进行清肠的比例不高，因为现在有更合理、更符合生理需求的清肠药物，比如聚乙二醇，以及轻泻药利那洛肽的辅助，和乳果糖的辅助。
硫酸镁多数用于清洁肠道、洗肠效果不理想，或者不具备聚乙二醇等符合生理条件洗肠药的地区，还有配制硫酸镁。一旦服用硫酸镁，按照浓度而言，很快就会起效，如果便秘的人，实际上半个小时到1个小时会出现开始排便的反应。
服用硫酸镁后，一般平均2个小时开始清得差不多，到3个小时完全清干净的可能性较大。因此多数是用在便秘的人，或者是已经用常规的洗肠效果不理想的人，才会给予硫酸镁的处置，现在临床配置较少。
