舌底长透明水泡，常见原因如下：
1、舌下腺囊肿：为最常见原因，舌下腺是人体6个较重要的腺体之一。唾液由于某种原因无法流出，导致发生潴留而引发舌下腺囊肿。若经过B超、临床检查、穿刺抽出的黏稠样液体，并且结合CT等，予以明确诊断后，一般考虑通过手术切除囊肿，同时也需要切除舌下腺。一般只要切除干净，复发可能性则较低。但一旦有腺体残留，则可能会复发；
2、黏液囊肿：若舌底长的透明水泡较小，如3-5mm或5-6mm，多考虑是黏液囊肿。可通过手术治疗，此手术较小，无需全身麻醉，进行局部麻醉切除囊肿即可。切除囊肿后，可以进行病理检查，如果病理证实是黏液囊肿，相对处理较简单。部分黏液囊肿可能会复发，复发后可以再次进行手术，一般不会对患者造成较严重的伤害。
综上，当舌底发现透明水泡后，需及时就诊，且无需过于担心。因为无论是舌下腺囊肿，还是黏液囊肿，治疗都是较成熟的方案。
