小孩若出现牙瘘管有一定的危害性，因为一旦形成瘘管，很大可能是由于龋病发展为牙髓炎，牙髓炎发展为根尖周炎。
一开始仅是龋病，如浅龋，随着其食物嵌塞严重，以及小孩长期吃零食或是蔗糖类食物，从而导致炎症扩散发展为中龋。中龋继续发展为深龋，深龋发展为牙髓炎，牙髓炎未得到及时控制，发展为根尖周炎，瘘管才会形成。
瘘管一旦形成，提示炎症已经从牙槽骨彻底穿透，从牙龈上引流。瘘管会造成牙槽骨吸收以及牙槽骨的损伤，并且造成牙龈的损伤。
再者，对有瘘管的小孩，大部分情况下牙齿治疗较棘手，小孩的根尖炎症，可能会影响恒牙以及牙周健康。因此对小孩牙瘘管，还是要进行根管治疗术，完善根管治疗术后，将炎症去除，以免影响恒牙萌出。
