肛裂和肛瘘是发生在肛门周围的两个疾病，但是完全不同两种疾病，肛瘘主要是由于肛内肛腺发生感染后引起，一般由肛周脓肿发展而来，因此一般有肛周脓肿病史，同时肛周脓肿破溃后或肛周脓肿医生切开排脓后形成瘘管，一般由内口、外口和瘘管三个部分组成，在发作时以肛周红肿、疼痛、流脓等症状为主要表现。

肛裂是因为便秘等因素导致肛管皮肤全层裂开，并且因为裂口继发感染而形成慢性溃疡，肛裂一般发生在截石位6点和12点位，各种原因都可能导致肛管皮肤破裂，例如大便干燥、排便困难，排便时因为粗糙大便也有可能导致肛管皮肤撕裂，因为异物损伤肛管皮肤或其它原因导致肛管皮肤破裂，例如炎症性肠病，这时裂口如果再继发感染会形成溃疡性裂口，也可能引起肛窦炎、肛乳头炎和肛乳头增生肥大。肛裂症状主要表现为便血和排便时肛门部剧烈疼痛或刀割样疼痛，排便后有时可以短时间缓解，部分疼痛剧烈情况在排便后缓解几分钟后又会出现持续性疼痛，便后持续较长时间才能缓解。因此肛裂或肛瘘是不同两个疾病，但如果肛裂裂口长时间不愈合，并且反复继发感染，也有可能在皮下形成皮下脓肿或皮下肛瘘可能。