霉菌性阴道炎较常用的冲洗液为小苏打或肥皂水等碱性冲洗液，治疗效果较好。此外，外阴瘙痒难受、有抓痕的女性可同时使用克霉唑软膏，将其涂抹于两侧大阴唇、阴蒂和会阴周围，可减轻外阴瘙痒。
霉菌性阴道炎的致病微生物为霉菌，目前临床上有针对性较强的药物可进行治疗，且疗效较好，较常见的如克霉唑阴道膨胀栓、阴道上药的凯妮汀(克霉唑阴道片)，以及口服药物如氟康唑等。上述药物在进行治疗时有口服和阴道上药的药物剂型，未婚、无性生活的女性可考虑使用口服药物如氟康唑等，而已婚女性阴道分泌物较多，可直接阴道上药，还可配合冲洗液进行冲洗。
