肋骨垫鼻基底的缺点，包括移位、吸收、材料比较紧张。用肋软骨垫鼻基底，该手术一般是与鼻综合手术同时进行，在采取肋软骨时，通常都是一根根肋软骨，这一根根肋软骨又要做鼻背移植物的修整，又要做鼻尖的支架的搭建，剩下的才能做鼻基底的填充，一般剩不了较大块。
所以对于选材，原材料来源就比较紧张，较多时候是选用一些边角料，即碎骨进行局部的填充。所以碎软骨在填充之后，容易出现随着面部表情、说话、吃东西、挤压，造成了局部的移位。另外也有可能会出现因为骨吸收，造成填充效果不够理想。
当然，不管是用什么材料进行填充，还有的缺点就是有可能会继发感染。如果继发感染，填充区域软骨的吸收率会较高，甚至有的为了控制感染时，还需要进行移植物的取出，保证局部的感染早期的恢复。所以一般而言，肋软骨垫鼻基底的缺点，主要在于材料紧张，另外一个就是移位，其他的都是常规的缺点。
