建议HPV16感染的患者增强抵抗力，建立较为规律的作息习惯，同房时最好全程佩戴避孕套，避免伴侣之间发生交叉传播，随后定期随访，此为目前最佳的治疗方案。目前的研究结果显示，针对HPV感染并没有疗效确切的特效药，无论是临床上使用的干扰素还是生物蛋白胶，据目前获得的临床数据分析，针对HPV感染并没有很强的疗效，针对性不强，转阴的效果也较为不理想。

目前针对HPV16感染或者HPV高危型的其它感染，最佳的治疗方案还是以随访为主。若在检查的过程中，TCT正常，HPV阳性，需转诊阴道镜，若阴道镜下无异常，就可每隔1年定期随访，监测到HPV转阴为止。若细胞学的检查也有问题，阴道镜检查有问题，就需在阴道镜下取一定的活检，来了解宫颈有无癌前病变或者癌变的情况。如果有，需尽早进行手术治疗。因此HPV16感染的治疗是需要长期监测的过程。