目前为止，可能没有专门针对肠黏膜修复的黏膜保护剂，或者黏膜修复剂，日常中经常用到的黏膜保护剂，主要针对胃黏膜，但对肠黏膜修复也具有一定作用，如硫糖铝、磷酸铝凝胶或铝碳酸镁等。
部分药物成分，从机理上而言，对消化道黏膜都有一定修复作用，如瑞巴派特、替普瑞酮、索法酮等，具有改善上皮血供，促进上皮细胞增生，调节上皮细胞黏膜免疫等作用，因此从作用机制上推断，上述药物对肠黏膜修复，也有一定作用。
另外，部分中成药，如康复新液，可能肠黏膜，也具有一定的修复作用。此外，黏膜营养药物，如谷氨酰胺类药物，能够为黏膜上皮提供营养和能量，在黏膜损伤时，此类也能够促进肠黏膜修复。
