桉柠蒎肠溶软胶囊的不良反应，主要有胃肠道不适和过敏反应。胃肠道不适包括恶心、腹痛、反酸等症状，而过敏反应有皮疹、面部浮肿、呼吸困难和循环障碍。通常桉柠蒎肠溶软胶囊的不良反应都比较轻微，基本不用干预患者即可自行耐受，但如果发生比较严重的恶心、呕吐、皮疹、呼吸困难等病症，则建议立刻停药并就医，由医生通过胃镜检查，或血常规来进行评估。如果出现胃炎、胃溃疡等病症，患者则应遵医嘱服用奥美拉唑片，或瑞巴派特片等。如果是过敏反应，则应遵医嘱服用马来酸氯苯那敏片，或依巴斯汀片等抗过敏药。
桉柠蒎肠溶软胶囊是通过改善气管黏膜纤毛运动，促进呼吸道腺体分泌，并增加黏液的移动速度。而发挥祛痰作用的黏液溶解性祛痰药，临床适用于急慢性鼻窦炎、支气管炎和肺炎等呼吸道疾病的辅助治疗，其主要成分为桉油精、柠檬烯和α-蒎烯。由于并没有靶向性，或选择性，因此桉柠蒎肠溶软胶囊的药理作用，可能会影响患者全身的器官，从而出现治疗目的以外的有害作用，即不良反应。
