亚临床甲亢的治疗，首先要评估亚临床甲亢是短期状态还是长期状态，是否会引起心脏或者其它方面损伤。进行评估后，再进一步治疗。这些涉及患者年龄、甲功变化等因素，需要临床医生根据情况进行评估。
普通亚临床甲亢患者，先控制高碘食物的摄入，即饮食调整为低碘饮食，如选用不加碘盐或尽量不吃海鲜类食物等。调整为低碘饮食后，可以1-2月后再进行复查。部分患者通过调整饮食后，甲状腺功能可恢复正常，此时不需要特殊处理。
而有些患者复查后发现甲状腺功能是亚临床甲亢状态，这时应根据年龄、心血管风险等因素，考量是否给药。所以亚临床甲亢患者可以先进行饮食控制，然后进行复查和评估，决定下一步治疗。
