唇腭裂手术并非一次完成，还需进行唇裂手术、腭裂手术以及牙槽突裂手术。唇裂手术主要是恢复鼻唇部正常外观，手术瘢痕的恢复非常重要，年龄越小手术所形成的瘢痕也就越小，因此应及早进行。此外，需注意麻醉的安全性，唇裂手术的最佳手术年龄设定在出生后3-6个月。
腭裂手术主要的目是为了恢复进食和语音功能，应在1岁之前完成腭裂修复手术。但是腭裂修复手术又会影响颌骨发育，其最佳手术年龄仍存在争议，越早进行对语音发育影响越有利，而对颌骨发育影响越不利，可在出生后8-18个月完成腭裂修复手术。
牙槽突裂手术对颌骨发育的影响更为明显，应在9-11岁完成牙槽突裂植骨。此年龄段为尖牙萌出的时间，应在尖牙萌出之前为其创造萌出的有利条件，因此在9-11岁完成牙槽突裂植骨较为合适。
