多发肾结石的患者需要区分对待，具体如下：

1、结石较小：如果双肾多发肾结石，每个结石都不大，可以采用自然的方法帮助患者将结石排出，一方面可以让患者多饮水、多排尿，另一方面可以让患者多做全身有氧运动，运动主要以蹦、跳或慢跑全身的运动为主。同时可以采用清热利湿，活血化瘀的中药和中成药来帮助患者排石，常用的中成药包括金钱草颗粒、排石颗粒、尿石通丸等，常用的中草药包括金钱草、海金沙、石韦、瞿麦、车前草、鸡内金等；

2、结石较大：如果双肾结石的结石都比较大，尤其是对于双肾铸型结石，则需要采用手术治疗，通常会先处理一侧结石，之后再处理另一侧的结石，到底先处理哪一侧结石取决于双肾结石的大小以及双肾结石是否对患者的肾功能造成影响。如果双肾结石并没有对患者肾功能造成影响，患者肾功能完全正常，则要先处理好处理的一侧，即先做手术好做的一侧，之后再处理对侧的肾结石。如果患者已经出现了肾功能异常，则要评估患者两侧肾哪侧较好，要先挽救肾功能较好的一侧肾脏，先手术处理这侧的肾结石，之后再处理对侧的肾结石。