肿瘤穿刺检查是判断肿瘤性质的一项有创性的检查方式，这种检查会对患者造成一定损害，因此应该谨慎。肿瘤在穿刺过程中需要做局部麻醉，有的可能还需要做全身麻醉，因此存在麻醉风险，并且麻醉药物对于患者的肝脏、肾脏、脑细胞都有一定损害。
此外，肿瘤穿刺还可能会穿破周围的正常组织或者穿破到血管、神经等部位，从而导致局部出血或神经损伤导致的麻木症状。而有的患者可能还会出现比较明显的大出血，危及到生命安全，如果在穿刺过程中操作不慎，还可能导致肿瘤细胞从穿刺点处发生周围组织的播散，从而导致疾病发展。
因此需要在影像学的评估下或者影像学的检查支持下来做这项操作，并且操作前需要向患者以及家属讲明穿刺的必要性以及可能的风险。
