甲胎蛋白在临床上最常用于肝癌的辅助性诊断，所以当甲胎蛋白偏高时，首先会关注患者是否存在肝癌。除肝癌外，还有其他很多原因会导致甲胎蛋白升高。

比如消化道来源的肿瘤，包括胃癌、胰腺癌，生殖胚胎来源性的肿瘤，比如卵巢癌、睾丸癌或者畸胎瘤。当然还有慢性肝病这种活动期也会有此种现象。因此，需要了解患者到底有没有肝炎、肝硬化。

以上提到的疾病，实际上都会导致甲胎蛋白的升高。但这种升高往往是持续性，会越来越高。比如10µg/L、20µg/L、100µg/L、200µg/L等，因为肿瘤存在以后，会持续性生长。因此，甲胎蛋白的水平，会逐步增高。

还有一种情况称之为生理性甲胎蛋白升高，这种情况下，甲胎蛋白总是略高于正常值，但是不会出现持续性的升高。如果做相关检查，排除上述脏器疾病，实际上只需要定期观察甲胎蛋白水平即可。

其发病的原因，其实并不是特别清楚，但这种甲胎蛋白的水平不会持续性升高，只会在一个略高的水平线上面上下波动。