50%-70%的幽门螺杆菌一次即可根除，还有部分是耐药性的幽门螺杆菌，需要采取不同措施，幽门螺杆菌根治采取三联或者四联疗法，通常选择10-14天，不必刻意延长疗程。具体用药一定要咨询医生，需要根据尿素呼气试验，以及感染严重程度，在此基础上选择三联或四联治疗，搭配抗生素。通常会选用2种抗生素，1种胶体铋剂，1种质子泵抑制剂进行治疗，并且还要关注药物剂量。
根除按疗程服药以后停药1个月，一定要复查，了解对药物的敏感性，以及根除效果。避免过早复查，因为有可能会出现假阴性，但也不能过晚复查，因为人体对细菌没有抵抗力，根除后还可能再次感染，通常会在家人中间出现聚集性感染，因此太长时间复查难以辨别是否根除或者再感染。
