肝胆外科主要治疗以下几方面疾病：

1、肝脏：肝脏的各种恶性肿瘤，如果能做手术，比如肝癌、转移性肝癌，都需要外科手术。肝脏良性肿瘤，比如较大的肝囊肿，非常大的肝血管瘤或者肝腺瘤，诊断不清楚的肝脏大占位病灶，需要做手术明确或者手术处理；

2、胆囊：如胆囊良性疾病，胆囊腺肌症、胆囊结石，比较严重的胆囊炎需要切除胆囊，还可以治疗胆囊肿瘤；

3、胆管：包括胆管肿瘤，胆管癌分为肝门部胆管癌、胆管中段肿瘤，以及胆管末端肿瘤。如果胆管里有结石，内科ERCP(经内镜逆行性胰胆管造影)取不出来，需要做手术，也是由肝胆外科医生处理。胰头、十二指肠肿瘤，有时候肝胆外科医生也可以处理；

4、其它：肝脏疾病诱发的脾功能亢进、脾大、上消化道出血，有些医院肝移植也在肝胆外科进行。如果各种综合性肝病需要做肝移植，也是由肝胆外科处理，有的医院可能肝移植科是独立科室。