活检主要按活检的用途决定挂的科室，如果是肿瘤性病变，可在肿瘤科进行就诊。额外进行操作的科室，如超声介入科，或者CT引导下穿刺，可根据当地科室的设置，在相应就诊科室明确后续活检流程，从而完善病理。
做活检除肿瘤方面的因素外，还有其他因素，如胃部不适或者排便等肠道不适，需进行胃镜、肠镜检查。如果相关检查发现异常可疑的病变，活检可能直接在胃肠内科，或者镜检科室进行。通过病理组织，后续在病理科进行相应诊断，明确具体性质变化。除外，还有呼吸系统疾病，主要在呼吸科就诊，如完善气管镜检查，必要时完善活检，均在呼吸科进行。
