肾结石的位置是在肾内，当结石在肾的不同部位时，表现为不同位置的结石。在肾脏解剖结构里有肾乳头，肾乳头下面有肾小盏，肾小盏汇集成肾大盏，肾大盏再汇集成肾盂，肾盂再和输尿管连接构成肾盂、输尿管连接部。结石在肾内，可以停留在肾小盏、肾大盏、肾盂，还可以卡在肾盂跟输尿管连接处。
结石在不同的部位，临床表现不同。如果结石仅在肾小盏、肾大盏或者肾盂里没有发生移动，患者没有任何的临床症状。有些患者会在尿常规检测中会发现尿液中红细胞水平超标，即出现血尿。如果结石出现在肾盂、输尿管连接部，卡在肾盂和输尿管连接处就会导致肾脏出现积水，同时患者会出现剧烈的腰腹部疼痛，伴有恶心、呕吐。
