肺结节手术的时间长短，与手术难易程度、结节大小、位置以及手术者或麻醉师的业务熟练水平密切相关。一般位于肺部边缘且<3cm的肺小结节，若术中冰冻为良性结节，做局部切除或楔形切除、剔除等手术，大约30min即可结束手术。若送检结节性质为浸润性肺癌，则需要做进一步的肺叶切除、肺段切除或全肺切除等手术，标准的肺叶清除加淋巴结清扫，大约需要1-2h才可完成。

当然若肺结节位于肺门深处，或者结节位置较靠近重要的血管和神经等组织，这时通常需要精细解剖，较耗时。此外若外科医生的操作较娴熟，手术过程会较快，若医生操作相对没那么熟练，则更需要耐心，手术时间也会延长。