慢性咽炎对核酸的检测没有影响，两者没有相关。慢性咽炎是咽部黏膜弥漫性、非特异性的炎症，常因细菌和病毒感染病程迁延不愈而导致。而核酸检测是通过采取鼻腔或咽部分泌物作为标本，通过检测感染病毒的核酸，判断是否有病毒核酸存在、是否有感染。
但核酸检测在临床上常出现假阳性或假阴性的情况，做法是采用多次取样本、多次检测，直到结果一致为止来作为判断。慢性咽炎在临床上很常见，多因急性咽炎反复感染造成，也可能是上呼吸道炎症、分泌物的刺激而导致，胃食道反流、胃酸的刺激也容易引起慢性咽喉炎。
慢性咽喉炎的患者会出现咽干、咽部不适、咽部堵塞感、咽部异物感等，查体发现咽黏膜慢性充血、咽后壁淋巴滤泡增生。治疗上多采用中成药物及局部治疗，不管是发作期还是慢性阶段，不影响核酸的检测。
