阿米巴痢疾灌肠常采取右侧卧位，病变部位主要在回盲部和升结肠，而回盲部和升结肠位于腹腔右侧。保留灌肠时是把所用药液抽吸到注射器内，连接上肛管，把肛管通过肛门送入直肠大约15cm的位置，把药液注入肛管。
药液经过直肠、乙状结肠、降结肠、横结肠到达升结肠及回盲部。右侧卧位时，回盲部和升结肠位于腹腔的最低位置，药液借助重力作用，不仅能很快到达病变部位，而且能停留下来，药液才能充分发挥作用。
阿米巴痢疾是由溶组织内阿米巴原虫侵入患者结肠壁引起的肠道传染病，原虫可以经过肠壁血管，也可以直接迁袭患者肝、肺、脑等脏器，造成肠外阿米巴病，如阿米巴肝脓肿、阿米巴肺脓肿及阿米巴脑脓肿等。
如果治疗不及时、不彻底，就会反复发作，造成病情迁延不愈，病程可长达数月甚至数年。
