奥美拉唑钠的作用，主要用于治疗消化性溃疡，包括胃溃疡和十二指肠的溃疡。还可以用于治疗反流性食管炎和卓-艾氏综合征，像胃泌素瘤的治疗。

奥美拉唑钠是苯并咪唑类的化合物，药理作用是通过特异性抑制胃壁细胞的氢钾ATP酶系统，阻断胃酸分泌的最后步骤。奥美拉唑钠的药理作用呈现的是剂量依赖性，即剂量增加、药物的药理作用也有所增强，并且可以使基础胃酸分泌和刺激状态下的胃酸分泌都受到抑制。

动物实验的研究结果显示，奥美拉唑钠在血浆内迅速消除以后，至少还可以在胃黏膜内存在24h，所以作用持续时间较长。同时奥美拉唑钠和克拉霉素、阿莫西林等三联、四联用药，可以用于根治幽门螺杆菌的感染。

使用奥美拉唑钠的过程中，还要注意药物的相互作用。因为奥美拉唑主要在肝脏中经过细胞色素P450酶代谢，所以本品和其它经过肝脏P450酶代谢的药物，如华法林，可能产生药物的相互作用。所以如果奥美拉唑和华法林联用的时候，需要注意监测华法林的血药浓度，必要时应该调整用药剂量。